Le CHU de Besançon se distingue dans le traitement des cancers de la peau (8e), de l'infarctus du myocarde (11e), l'audition (6e) la traumatologie de la face (10e) et les accouchements à risque (19e)
Côté cliniques, la clinique Saint-Vincent de Besançon est dans le top 10 pour le traitement des cancers de la prostate (6e) et la Polyclinique de Franche-Comté
Le classement par spécialité pour Besançon et Dijon
Ophtalmologie
Cataracte
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 27 | 16,19 |
| CHU Dijon | 4 | 18,49 |
| Hôpital Belfort Montbéliard | 7 | 18,24 |
| CH Vesoul | 33 | 15,78 |
| Clinique Saint Vincent | 27 | 16,76 |
Glaucome
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | 5 | 18,27 |
Rétine
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 21 | 15,76 |
| CHU Dijon | 3 | 18,67 |
Strabisme
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 17 | 15,90 |
| CHU Dijon | / | |
| Clinique Saint Vincent | / |
Cancers
Cancer ORL
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | / |
Cancer de l'estomac ou de l'œsophage
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | / |
Cancer de la prostate
| Classement | Note (/20) | |
| Clinique Saint Vincent | 6 | 17,67 |
Cancer de la thyroïde
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Dijon | 17 | 15,49 |
Cancer de la vessie
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | 37 | 15,94 |
Cancer du côlon ou de l'intestin
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 24 | 16,37 |
| CHU Dijon | 11 | 17,68 |
| CH Belfort Montbéliard | 38 | 15,38 |
Cancer du foie ou du pancréas
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 24 | 15,55 |
Cancer du poumon
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | 18 | 16,64 |
Cancer du rein
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Dijon | 27 | 15,65 |
Cancer du sein
| Classement | Note (/20) | |
| CHRU Besançon | 28 | 16,95 |
| CH Belfort Montbéliard | 14 | 17,78 |
| Centre G. François -Leclerc | 4 | 18,52 |
Cancers de la peau
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 8 | 16,95 |
| CHU Dijon | 17 | 16,19 |
Cancers gynécologiques
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 30 | 16,67 |
| CHU Dijon | 18 | 17,25 |
| CH Belfort Montbéliard | 9 | 18,10 |
| Polyclinique de FC | 29 | 15,28 |
Chirurgie des cancers osseux
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | / | |
| Clinique Saint Vincent | / |
Leucémie de l'adulte
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 20 | 16,85 |
| CHU Dijon | 14 | 17,54 |
Leucémie de l'enfant et de l'adolescent
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | / |
Tumeurs du cerveau
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 39 | 15,40 |
| CHU Dijon | 31 | 16,08 |
| Clinique Saint Vincent |
Chirurgie osseuse et articulaire
Chirurgie de l'épaule
| Classement | Note (/20) | |
| Hôpital privé Dijon | 11 | 17,59 |
Chirurgie de la cheville
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | 24 | 15,63 |
| Clinique Saint Vincent | / |
Chirurgie du canal carpien
| Classement | Note (/20) | |
| CH Pontarlier | 19 | 16,48 |
| Hôpital privé Dijon | 21 | 16,34 |
Chirurgie du pied
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | / | |
| Clinique Saint Vincent | / |
Ligaments du genou
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | / | |
| Clinique Saint Vincent | 14 | 16,95 |
Prothèse de genou
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | / | |
| Clinique Saint Vincent | 8 | 17,61 |
Prothèse de hanche
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | 23 | 16,78 |
| Clinique Saint Vincent | 24 | 17,05 |
Urgence de la main
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 25 | 15,46 |
| CHU Dijon | / | |
| Hôpital privé de Dijon | 7 | 17,81 |
Chirurgie digestive
Appendicite
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | 26 | 16,80 |
| CH Belfort Montbéliard | 28 | 16,63 |
Chirurgie de l'obésité
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | / | |
| Hopital Privé Dijon | 13 | 16,63 |
Chirurgie du rectum
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 33 | 15,83 |
| CHU Dijon | 34 | 15,70 |
| Clinique Saint Vincent |
Hernies de l'abdomen
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | 44 | 15,83 |
| Clinique Saint Vincent | 25 | 16,85 |
Proctologie
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | 36 | 15,76 |
| Polyclinique de FC | 9 | 17,42 |
Vésicule biliaire
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 43 | 15,61 |
| CHU Dijon | 5 | 17,72 |
| CH Belfort Montbéliard | 4 | 17,73 |
| Polyclinique de FC | 44 | 16,21 |
Chirurgie vasculaire
Chirurgie des artères
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 26 | 15,83 |
| CHU Dijon | 24 | 16,03 |
| Clinique Saint Vincent | 9 | 17,12 |
Chirurgie des carotides
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 28 | 15,30 |
| CHU Dijon | 21 | 16,36 |
| Clinique Saint Vincent | 15 | 16,45 |
Varices
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | / | |
| Clinique Saint Vincent | / |
Cardiologie
Chirurgie cardiaque
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 21 | 16,46 |
| CHU Dijon | 8 | 17,98 |
Hypertension artérielle
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 21 | 16,88 |
| CHU Dijon | 37 | 15,49 |
Infarctus du myocarde
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 11 | 18,16 |
| CHU Dijon | 6 | 18,82 |
Stimulateurs cardiaques
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 39 | 15,86 |
| CHU Dijon | 18 | 17,77 |
| Clinique Saint Vincent | 32 | 15,67 |
Urologie / gynécologie
Adénome de la prostate
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | 39 | 16,08 |
| CH Belfort Montbéliard | 15 | 17,33 |
Calculs urinaires
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 28 | 16,35 |
| CHU Dijon | / | / |
| CH Belfort Montbéliard | 11 | 17,54 |
Chirurgie des testicules
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 20 | 15,26 |
| CHU Dijon | / |
Incontinence urinaire
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | / | |
| CH Belfort Montbéliard | 27 | 16,06 |
| Polyclinique de FC | 24 | 15,71 |
Neurologie / neurochirurgie
Accidents vasculaires cérébraux
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | / |
| CHU Dijon | 8 | 18,3 |
Anévrismes cérébraux
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | / |
| CHU Dijon | 12 | 17,21 |
Chirurgie de l'hypophyse
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | / | |
| Clinique Saint Vincent | / |
Épilepsie
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 13 | 16,91 |
| CHU Dijon | 21 | 16,21 |
Chirurgie du dos
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 17 | 17,19 |
| CHU Dijon | 10 | 17,68 |
| Clinique Saint Vincent | 12 | 17,38 |
Neurinome
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | / | |
| Clinique Saint Vincent | / |
Sclérose en plaques
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 21 | 15,87 |
| CHU Dijon | 11 | 17,56 |
Tête et cou
Amygdales et végétations
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 15 | 17,72 |
| CHU Dijon | / | |
| CH Belfort Montbéliard | 6 | 18,74 |
| Clinique Saint Vincent | 30 | 16,21 |
Audition
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 6 | 17,86 |
| CHU Dijon | 35 | 16,34 |
Chirurgie de la cornée
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | / | |
| Clinique Saint Vincent | / |
Chirurgie dentaire et orale
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 38 | 16,10 |
| CH Belfort Montbéliard | 19 | 17,55 |
| CHU Dijon | 11 | 18,05 |
Chirurgie du nez et des sinus
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 16 | 17,08 |
| CH Belfort Montbéliard | 11 | 17,55 |
| CHU Dijon | / | |
| Clinique Saint Vincent | 16 | 17,24 |
Chirurgie maxillo-faciale
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 16 | 17,48 |
| CHU Dijon | 20 | 17,26 |
Glandes salivaires
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | 25 | 15,59 |
| Hôpital Privé Dijon | 9 | 17,26 |
Traumatisme crânien
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | 23 | 16,72 |
Traumatologie de la face
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 10 | 16,72 |
| CHU Dijon | 9 | 16,82 |
| Clinique Saint Vincent |
Maladies du voyageur
Maladies infectieuses et du voyageur
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 35 | 16,17 |
| CHU Dijon | 17 | 17,77 |
Maladies respiratoires
Pneumologie
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 21 | 16,87 |
| CHU Dijon | 19 | 17,01 |
Autres spécialités médicales
Diabète
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 33 | 15,85 |
| CHU Dijon | 17 | 17 |
Hépatites virales
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | 25 | 15,79 |
Maladies hormonales
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 12 | 17,43 |
| CHU Dijon | 18 | 17,20 |
Pédiatrie
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | / |
| CHU Dijon | 39 | 16,5 |
Rhumatologie
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | 50 | 15,34 |
Urgences
Urgences traumatologiques
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 35 | 15,63 |
| CHU Dijon | 32 | 15,82 |
Psychiatrie
Dépression
| Classement | Note (/20) | |
| CHS La Chartreuse Dijon | 25 | 16,54 |
Schizophrénie
| Classement | Note (/20) | |
| CHS La Chartreuse Dijon | 38 | 16,02 |
Maternités
Accouchements normaux
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | / | |
| CHU Dijon | / | |
| CH Belfort Montbéliard | 11 | 17,61 |
| Polyclinique de FC | 41 | 16,55 |
Accouchements à risques
| Classement | Note (/20) | |
| CHU Besançon | 19 | 16,95 |
| CHU Dijon | 21 | 16,81 |