"Souhaitez-vous que la Franche-Comté se sépare de la Bourgogne afin de pouvoir à nouveau disposer de son propre Président, de ses propres élus, de son propre budget et de son propre drapeau ?" telle est la question posée dans la pétition du MFC.
Huit ans après la loi relative à la délimitation des régions (16 janvier 2015), le parti régionaliste lutte encore et toujours pour que la Franche-Comté soit indépendante de la Bourgogne que ce soit au niveau de sa présidence, de son budget ou encore de son drapeau. Régulièrement, Jean-Philippe Allenbach dénonce notamment l’absence du drapeau franc-comtois sur la façade de l’hôtel de ville de Besançon ainsi que le budget de la Bourgogne Franche-Comté qui pénaliserait les Francs-Comtois.
À ce jour, la pétition a récolté 65 signatures.